মধুপুর উপজেলায় ১১ টি ইউনিয়ন এবং ১টি পৌরসভা রয়েছে। প্রতিটি ইউনিয়ন ৩ টি ব্লকে বিভক্ত করে মোট ৩৩ টি এবং পৌরসভা কে ১ টি ব্লক হিসেবে মোট ৩৪ টি ব্লকে বিভক্ত করে উপজেলার কৃষি কার্যক্রম চালনা করা হয়। প্রতিটি ব্লক এবং পৌরসভার দায়িত্বে ১ জন করে উপহকারী কৃষি কর্মকর্তা রয়েছে।পৌরসভা,মির্জাবাড়ি,গোলাবাড়ি ইউনিয়নে ১ টি করে ফিয়াক সেন্টার স্থাপন করা হয়েছে কৃষি সেবা ত্বরান্বিত করার জন্য।উপজেলা কৃষি অফিস থেকে তাদের কার্যক্রম নিয়মিত মনিটর করা হয়।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস